Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRAM2Q15035 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms