Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HNF4GQ14541 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms