Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CKAP5Q14008 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CKAP5Q14008 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CKAP5Q14008 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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