Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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