Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF5Q12774 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF5Q12774 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms