Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYCNQ0VAF6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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