Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFN5Q08AF3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms