Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms