Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms