Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms