Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms