Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms