Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOSBP53539 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOSBP53539 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms