Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCT3P49368 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCT3P49368 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCT3P49368 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCT3P49368 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCT3P49368 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCT3P49368 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms