Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP5P45974 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP5P45974 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP5P45974 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP5P45974 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms