Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC1A2P43004 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms