Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LSP1P33241 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LSP1P33241 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LSP1P33241 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSP1P33241 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LSP1P33241 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms