Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms