Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIG1P18858 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIG1P18858 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIG1P18858 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIG1P18858 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIG1P18858 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms