Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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