Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms