Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYBBP04839 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms