Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCAP01258 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms