Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms