Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGPSO00116 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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