Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms