Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms