Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms