Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PADI4Q9UM07 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms