Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms