Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms