Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
KRTAP2-4Q9BYR9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms