Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCD2Q9BXW9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms