Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SORT1Q99523 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SORT1Q99523 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SORT1Q99523 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SORT1Q99523 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SORT1Q99523 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SORT1Q99523 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SORT1Q99523 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SORT1Q99523 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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