Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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