Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms