Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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