Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.1 ms