Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PGAM5Q96HS1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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