Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HDAC10Q969S8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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