Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms