Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHD5Q8TDI0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms