Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3LQ8TDB6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX3LQ8TDB6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms