Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms