Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00523Q86TU6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms