Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE16Q7Z3T8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms