Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2R2Q712K3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2R2Q712K3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms