Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL6Q6ICC9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL6Q6ICC9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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