Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C10orf55Q5SWW7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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