Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms